Using Bean pod mottle virus (BPMV) as virus-induced gene silencing (VIGS) vector to target multiple genes in Glycine max (L.) Merr.

الموضوعات

علوم بحتة وطبيعية

الملخص

Plant viral vectors are valuable tools for host gene analysis, thus possessing important applications as reverse genetics tools for gene function studies. Bean pod mottle virus (BPMV) is a bipartite, positive-sense (+) RNA virus of Secoviridae. Insertion of relatively short cDNA fragments (96nts) corresponding to different regions of soybean (Glycine max) phytoene desaturase1 (GmPDS1) into the 3' UTR of BPMV RNA2 initiated weak photobleaching manifested by white spots along the veins of soybean leaves. MFold algorithm was used to predict the RNA secondary structure of a 66 nucleotide region (nt #400-466) within the 5' UTR of BPMV RNA2. This region could potentially fold into a stem-loop (SL) designated as SLC. The functional analysis indicated the importance of the bottom section of the stem because disrupting this portion of structure completely abolished the BPMV infectivity. A 47 nt region, SLA, spanning from nt #263-309 of the 5' UTR of BPMV RNA2 was deleted. Nonviral inserts (GmPDS1 or GmPDS1/GmDCL4) of up to 325 and 625 nt, respectively, were tolerated by the same region and successfully down regulated the expression of their corresponding genes. Furthermore, one insertion mutant, V5UE-GmPDS1/GmDCL2, underwent recombination in the infected plants, leading to the truncation of 112nts (nt #250-361).

روابط وملفات

التعريف والنوع

رقم الوثيقة

0e19b87a-1b46-46b9-b758-06505d556820

رقم العقد

0

نوع الوسائط

Crawler

نوع المحتوى

الرسائل العلمية

صيغة المصدر

رسائل دكتوراة

نوع الملف

pdf text

أسماء الملفات

14755_1.pdf

بيانات النشر

ترجمة العنوان

ستعمال فيروس تبرقش قرنات الفاصوليا(BPMV (virus mottle pod Bean كناقل لتحفيز الكبت الجيني ألستهداف عدة جينات في نبات فول الصويا Glycine max (L.) Merr.

ألقاب المؤلفين

[{"name_ar":"أحمد خميس علي","title_ar":"اعداد","title_en":"Preparation"},{"name_ar":"كاظم محمد ابراهيم","title_ar":"اشراف","title_en":"Supervision"},{"name_ar":"ميسر مجيد جرجيس","title_ar":"اشراف","title_en":"Supervision"}]

اللغة

English

المصدر والدورية

اسم المصدر

Using Bean pod mottle virus (BPMV) as virus-induced gene silencing (VIGS) vector to target multiple genes in Glycine max (L.) Merr.

المحتوى والصفحات

عدد الصفحات

0

ترجمة الملخص

تعد النواقل المشتقة من الفيروسات النباتية وسيلة قيمة للتحليل الجيني للنباتات المضيفة لتلك الفيروسات, ولها خواص مهمة في دراسة وظائف الجينات. ينتمي فيروس تبرقش قرنات الفاصوليا (BPMV, virus mottle pod Bean (والذي يمتلك جزيئتين موجبتين ومنفردتي السلسلة من الحامض النووي الرايبوزي (RNA sense positive (الى عائلة Secoviridae .ادى غرس قطع ( صغيرة نسبيا 69 قاعدة( من الدنا المتمم (cDNA (والمشتق من عدة مناطق من جين Phytoeneً ( الثانية للقطعة) 3' UTR) ضمن) Glycine max L.) Merr الصويا لفول desaturase 1, PDS1) من رنا الفيروس (RNA2 (الى استحداث قصر ضوئي ضعيف (photobleaching weak (والذي تمثل بظهور بقع بيضاء منتشرة على طول عروق اوراق فول الصويا. وظفت خورازمية MFold للتنبؤ بالتركيب الثانوي (structure Secondary (لقطعة طولها 99 قاعدة )محصورة بين قاعدة 044-099 )من النهاية UTR' 5 لقطعة الرنا الثانية (RNA2 (لفيروس BPMV .وجد ان لهذه القطعة امكانية االلتفاف بشكل loop-stem) SL (والتي سميت SLC .وجد ان الجزء السفلي من هذا التركيب له اهمية اساسية لحيوية الفيروس, اذ ان التالعب بهذا الجزء من التركيب ادى الى فقدان قدرة فيروسBPMV على االصابة. ازيلت 04 قاعدة والمحصورة بين قاعدة 392-246 من منطقة '5 UTR لقطعة الرنا الثانية (RNA2 (لنفس الفيروس والتي سميت )SLA .(غرست قطع من اصل غير فايروسي )GmPDS1 او GmDCL4/GmPDS1 )والتي بلغت اطوالها 233 و933 قاعدة على التوالي والتي تم تقبلها من قبل المنطقة المزالة, اذ ادت الى تثبيط التعبير الجيني لجيناتها المطابقة. من ناحية اخرى, عانى احد الطافرات (GmDCL2/GmPDS1-V5UE (من عملية اعادة ارتباط (Recombination (اثناء التضاعف داخل نبات فول الصويا وفقدان قطعة طولها 113 قاعدة )محصورة بين قاعدة 334-291 .)

إشراف وإعداد

الإشراف

كاظم محمد ابراهيم, ميسر مجيد جرجيس

الإعداد

أحمد خميس علي

الاقتباسات الببليوغرافية