Phenotyping, genotyping and immunological study of otitis media infection

الموضوعات

علوم تطبيقية وتكنولوجية

الملخص

Otitis media (OM) is an inflammation and infective condition of the middle ear mucosa. If the inflammation is accompanied by discharge and perforation in the tympanic membrane. This study was conducted in the Faculty of Science for Women, University of Babylon. Seventy-four clinical samples were collected from patients suffering from otitis media in different age groups, their ages ranged from (1–72) years, and the study period was from October 2022 to January 2023 in the hospitals of Babylon (Hilla Teaching, Imam Al-Sadiq). The current study was carried out with a number of steps, including the identification of bacteria and fungi associated with otitis media. Bacteria were identified by routine, molecular, and antibacterial efficacy tests; fungal isolates were identified by traditional methods and the antifungal efficacy of fungal isolates. The results showed that 62 of the samples gave growth for bacteria and the other 12 samples did not show growth for bacteria. Fungi gave 59 positive samples for culture and 15 negative for culture. The results of gender showed that the percentage among females was (55.5%) higher than among males, as it reached (44.5%) among males. This study revealed that the most affected age among both sexes ranged from (20–40 years). As well as the distribution of patients according to the situation of the living area in the city with a rate of (75.7%) and in the countryside (24.3%). Those who took antibiotics were recorded in this study (56.8%) of those who did not take (43.2%). Chronic otitis media was the highest rate among patients (26.6%), and acute (37.8%). Of the clinical samples, Pseudomonas aeruginosa bacteria had the highest presence 24 (32.4%) followed by Staphylococcus aureus 19 (25.7%). The most abundant resistant strain of Pseudomonas aeruginosa exhibited varying levels of resistance to seven different antibiotics, with the highest resistance observed against Polymyxin B, Gentamicin, and Ceftriaxone. On the other hand, it showed the highest sensitivity to Imipenem. Conversely, Staphylococcus aureus strains displayed the highest resistance to Tetracycline and Amoxicillin, while showing high sensitivity to Levofloxacin. To identify the fungi present, the specimens were cultured on SDA medium. After their growth, they were microscopically examined and CROMagar medium was used for the diagnosis of Candida spp. The results revealed the predominance of Aspergillus spp. isolates, with the highest percentage being A. niger (36.5%), followed by A. flavus (31.1%). Four species of yeast were also isolated and identified from patient samples, with the highest percentage attributed to C. glabrata and C. krusei, accounting for 12.2% and 8.1%, respectively. The second most prevalent yeast species was C. albicans, with a percentage of 4.1%. The most effective antifungal agents in this study were clotrimazole, itraconazole, nystatin, and amphotericin B, which exhibited the highest sensitivity against the fungi. Otitis media (OM) was also studied by genotyping 60 specimens — 30 patients with OM and 30 healthy individuals. This was done to detect genotypic polymorphisms for two genes, MUC5B and IL-1RN, using the variable numbers of tandem repeats (VNTR) region. The results indicate that carriers of allele 2 have an almost doubled risk of developing otitis media. A genetic polymorphism analysis of IL17A was conducted on 60 specimens of human blood DNA, including 30 patients and 30 healthy individuals. The frequency of risk allele A in both heterozygous (GA) and homozygous (AA) genotypes in SNP rs2275913 was based on the Odds Ratio. The results showed lower frequency in genotype GA with OR = 0.57 (0.18–1.72) and p-value 0.3, and the allele frequency was lower with A allele. Based on the ELISA method, the level of TNF in the serum was measured in 25 patient samples compared to 10 healthy individuals. The results indicated a difference in tumor necrosis factor-alpha (TNF-α) between the patients and the healthy subjects (272.85 ± 132.21 for patients vs 200.5 ± 36 for the control group). The distribution of serum TNF-α was also analyzed according to bacterial types. The results of the statistical analysis showed a significant increase (P < 0.05) in serum TNF-α in Pseudomonas aeruginosa bacteria compared to other bacteria. Furthermore, the age group below 20 years had the highest TNF-α level (285.41), followed by the age group above 40 years with a TNF-α level of (264.19), while the lowest level of TNF-α (107.48) was observed in the age group of 20–40 years. The effect of gender on TNF-α levels was examined, and the statistical analysis results indicated no significant effect (p > 0.05) of gender on the levels of TNF-α in both males and females. The statistical analysis showed a significant increase in TNF-α levels in patients with the chronic stage compared to the acute stage.

روابط وملفات

التعريف والنوع

رقم الوثيقة

0104078d-f914-4fe2-86df-bcf212c82ab7

رقم العقد

0

نوع الوسائط

Crawler

نوع المحتوى

الرسائل العلمية

صيغة المصدر

رسائل ماجيستير

نوع الملف

pdf text

أسماء الملفات

993309_1.pdf

بيانات النشر

ترجمة العنوان

دراسة مظهرية وجزيئية ومناعية لعدوى التهاب الأذن الوسطى

ألقاب المؤلفين

[{"name_ar":"صفا عامر خليل","title_ar":"اعداد","title_en":"Preparation"},{"name_ar":"كوثر محمد علي حسن","title_ar":"اشراف","title_en":"Supervision"}]

اللغة

English

المصدر والدورية

اسم المصدر

Phenotyping, genotyping and immunological study of otitis media infection

المحتوى والصفحات

عدد الصفحات

0

ترجمة الملخص

التهاب الأذن الوسطى هو التهاب وحالة معدية في الغشاء المخاطي للأذن الوسطى. وقد يكون مصحوبًا بإفرازات وانثقاب في غشاء الطبلة.أجريت هذه الدراسة في كلية علوم للبنات بجامعة بابل. وقد جمع ٧٤ عينة سريرية من المرضى الذين يعانون من التهاب الأذن الوسطى بمختلف الفئات العمرية تراوحت أعمارهم من 1-72 سنة وكانت فترة الدراسة من أكتوبر 2022 إلى يناير 2023 في مستشفيات بابل (الحلة التعليمي، الأمام الصادق) .وتمت الدراسة الحالية بعدد من الخطوات منها تشخيص البكتيريا والفطريات المرافقة لالتهاب الاذن. شخصت البكتيريا عن طريق الاختبارات الروتينية ، والجزيئية . ودراسة فعالية المضادات البكتيرية، وتم تشخيص العزلات الفطرية بالطرق التقليدية والتعرف على فعالية المضادات الفطرية للعزلات الفطرية. وأظهرت النتائج ان ٦٢ من العينات أعطت نمو للبكتيريا و١٢عينة لم تظهر نمو للبكتيريا .وأعطت الفطريات ٥٩عينة موجبة للزرع و ١٥عينة سالبة للزرع.أظهرت نتائج المرضى نسبة الإناث كانت (55.5% (أعلى منها عند الذكور حيث بلغت عند الذكور (44.5%) وقد كشفت هذه الدراسة أن السن الأكثر تضرراً بين الجنسين تتراوح أعمارهم (40- 20سنة). وكذلك توزع المرضى حسب وضع المنطقة المعيشية في المدينة بنسبة (75.7%) وفي الريف (24.3 %) وسجلت هذه الدراسة الذين تناولوا مضاد حيوي (56.8%) من الذين لم يتناولوا (43.2%).وقد كان إلتهاب الأذن المزمن هو الأعلى نسبة بين المرضى )62.2%) والحاد (37.8%) من العينات السريرية. بكتيريا الزائفة الزنجارية هي الأعلى تواجد 24)32.4%) تليها المكورات العنقودية الذهبية 19 (25.7%). بكتيريا الزائفة الزنجارية الأكثر وفرة كشفت عن مستويات مقاومة مختلفة اتجاه 7 أنواع من المضادات الحيوية كان الأكثر مقاومة polymyxin B و Gentamicin وCeftriaxone واكثر حساسية Imipenem بينما أظهرت المكورات الذهبية اعلى مقاومة Tetracyctine و Amoxicillin واظهرت حساسية عالية اتجاه Levofoxacin.ولتشخيص الفطريات زرعت العينات على وسط SDA للتعرف على الفطريات وبعد نموها تم فحصها مجهريا واستخدم وسط CROMAgarوذلك لاستعماله في تشخيص أنواع Candida spp . وبينت النتائج سيادة جنس Aspergillus spp والأنواع التابعة له وكان اعلى نسبة نوع A . niger (36.5%) يتبعه A.flavus(31.1% ).تم أيضًا عزل أربعة أنواع خميرة من عينات المرضى، وكانت أعلى نسبة تعزى إلى C. glabrata وC. krusei، حيث بلغت 12.2% و8.1% على التوالي. ثاني أكثر أنواع الخميرة انتشارا هي C. albicans بنسبة 4.1%أكثر مضادات الفطريات فاعلية في هذه الدراسة هي كلوتريمازول , يتراكونازول ونيستاتين و الأمفوتريسين-ب لها أعلى نسبة حساسية ضد المبيضات.تم دراسة التهاب الأذن الوسطى عن طريق التنميط الجيني لـ 60 عينة، 30 مريضًا مصابًا بالتهاب الأذن الوسطى و30 فردًا سليمًا. يتم ذلك للكشف عن تعدد الأشكال الجيني لجينين، MUC5B و IL-1RN، باستخدام الأعداد المتغيرة لمنطقة التكرارات الترادفية (VNTR). تشير النتائج إلى أن حاملي الأليل 2 لديهم خطر الإصابة بالتهاب الأذن الوسطى بمقدار الضعف تقريبًا.تم إجراء تحليل تعدد الأشكال الجيني لـ IL17A على 60 عينة من الحمض النووي لدم الإنسان، بما في ذلك 30 مريضًا و30 فردًا سليمًا. تواتر أليل الخطر A في كل من متغاير الزيجوت (GA) ومتماثل الزيجوت AA في SNP rs2275913. النتائج الموضحة أقل في النمط الجيني GA كانت OR= 0.57 (0.18 - 1.72) مع قيمة p 0.3، وكان تردد الأليل أقل مع الأليل A.واعتمادًا على طريقة ELISA تم قياس مستوى TNF-α في مصل الدم 25 عينة للمرضى مقابل 10 أصحاء وبينت النتائج اختلاف TNF-α بين المرضى والأشخاص الأصحاء(272.85±132.21 مريض مقابل 200.5± 36 مجموعة السيطرة). وكان توزيع مصل TNF-α وحسب الأنواع البكتيرية. حيث أظهرت نتائج التحليل الإحصائي زيادة معنوية (P 0.05)‏ للجنس على مستوى كل من الذكور والإناث. وأظهرت نتيجة التحليل الإحصائي زيادة معنوية في مستويات TNF-α في المرضى الذين يعانون من المرحلة

كلمات الباحثين

Otitis media, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, fungi, antibiotic resistance, antifungal agents, MUC5B, IL-1RN, IL17A, TNF-α, genetic polymorphism, ELISA.

إشراف وإعداد

الإشراف

كوثر محمد علي حسن

الإعداد

صفا عامر خليل

الاقتباسات الببليوغرافية