رسائل دكتوراة
French
2022
Investigation et étude des champignons pathogènes des espèces forestières des dunes littorales Nord de la Tunisie
Mohamed Lahbib Ben Jamâa, Sawssen Hlaiem
المعهد الوطني للعلوم الفلاحية - تونس-جامعة قرطاج · تونس
Les champignons phytopathogènes sont parmi les principales causes des maladies des espèces forestières. Dans ce travail de thèse, des investigations ont été effectuées afin de caractériser les manifestations symptomatiques des espèces forestières dépérissantes en relation avec les champignons pathogènes repérés dans deux forêts dans le nord-est (Henchir Kort) et dans le nord (Rimel) de la Tunisie. L'identification des agents fongiques a été réalisée à l'aide de deux méthodes morphologique et moléculaire ; l’évaluation du pouvoir pathogène des isolats obtenus a été effectuée; la croissance mycélienne des champignons a été évaluéeà des températures allant de 5°C à 40°C et des essais d'antagonisme ont été effectués par confrontations directe et indirecte entre quelques champignons pathogènes et la souche antagoniste de Trichoderma obtenu dans cette étude. Une collection de 115 isolats a été obtenue provenant des branches symptomatiques des arbres de pins (Pinus halepensiset P. pinea) et des espèces de maquis (ex: Juniperus oxycedrus, Tetraclinis articulata, Pistacia lentiscus, Olea europeae,Erica arborea, Retama raetam, Quercus coccifera). Cinq differents genres ont été caractérisés: Botyosphaeria spp., Pestalotiopsis spp., Heterotruncatella spp. Alternaria spp. et Fusarium spp. Les résultats ont révélé que Botryosphaeria spp. étaient les champignons les plus fréquemment isolés suivis par Pestalotiopsis spp. Leur incidence sur les plantes semble être significativement corrélée aux paramètres dendrométriques et aux facteurs écologiques (P<0.000). La caractérisation morphologique et l'analyse phylogénétique de la régionde l'espaceur interne transcrit (ITS) de l'ADN ribosomal nucléaire, la séquence partielle du gène du facteur d'élongation de la traduction 1-alpha (EF1-α) et le gène de la β-tubuline ont permis d’identifier 12 espèces fongiques: Diplodia africana, D. scrobiculata, D. seriata, D. pseudoseriata, Neofusicoccum luteum, Pestalotiopsis biciliata, P. chamaeropis, Heterotruncatella spartii, Alternaria alternata, A. infectoriaet A. tenuissima et Fusarium oxysporum. L'évaluation de la pathogénie des isolats de Botryosphaeria et de Pestalotiopsisa confirmé leur agressivité en regard de leurs plantes hôtes. D. scrobiculatas’est montrée l’espèce la plus pathogène. Les résultats des températures révélaient que la température de croissance optimale des isolats testés était de 25°C. Les températures de 5°C et 40°C ont inhibé la croissance mycélienne de tous les champignons examinésà l'exception de D. seriata, qui pouvait croître à 40°C. le genre Trichoderma est le plus utilisé comme agent de lutte biologique. La caractérisation morphologique et moléculaire de la région ITS a permis d'identifier un isolat de l'espèce Trichoderma harzianum. Les essais de confrontation directe (sur milieu PDA) ou indirecte (à distance), entre quelques isolats et T. harzianum, ont montré que l'antagoniste a inhibé la croissance mycélienne des pathogènes par rapport au témoin non traité. En conclusion, la majorité des espèces forestières investiguées sont menacées par le phénomène de dépérissement et la forêt de Rimel est la plus dépéris. Ce déclin dont souffrent les forêts pourrait être lié essentiellement aux impacts des changements climatiques.