Etude in silico d'une mutation:application à la mutation fonctionnelle G719X du gène EGFR retrouvée dans les cancers bronchiques non à petites cellules

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علوم بحتة وطبيعية

الملخص

The EGFR gene is a tumor suppressor gene and its molecular alteration may increase the risk of branch cancer. In order to contribute to the molecular study, we were interested in of the deleterious effects of three mutations of the EGFR gene, namely the c.2155G>A mutation, the c.2156G>C mutation and c. 2155G>T. Thus, the deleterious effects of the three mutations were predicted using an in silico protocol consisting of different software (I-Mutant 2.0; SIFT; Polyphen-2; Project HOPE). The mutations c.2155G>A, c.2156G>C, c.2155G>T are predicted to be deleterious altering the EGFR protein. In fact, physicochemical changes between wild-type and mutated amino acids can disrupt protein stability and lead to loss of interactions with other molecules. Our results show that theses different are consistent and that their combination can improve the performance of predicting the effects of these mutations. This study allows us to better understand the impact of mutations and highlights the importance of predictive research in bioinformatics software. Le gène EGFRest un gène suppresseur de tumeur et son altération moléculaire peut augmenter le risque de cancer bronchique. Afin de contribuer à l'étude moléculaire, nous nous sommes intéressés à l'étude des effets délétères de trois mutations du gène EGFR, à savoir la mutation c.2155G>A, la mutation c.2156G>C et c.2155G>T.Ainsi, les effets délétères d'estriol mutations ont été prédites en utilisant un protocole d’étude in de différents logiciels (I-Mutant 2.0; SIFT; Polypes-2; Project HOPE).Les mutations c.2155G>A,c.2156G>C,c.2155G>Tsont prédites comme étant protéine EGFR.En fait, les changements physico-chimiques entre les acides aminés sauvagesse mutés peuvent perturber la stabilité des protéines et entraîner une perte d'interactions avec d'autres molécules. Nos résultats montrent que ces différents logiciels sont cohérents et que leur combinaison peut améliorer les performances de prédiction des effets de ces mutations.Cette étude nous permet de mieux comprendre l'impact des mutations et met en lumière l'importance de la recherche prédictive dans les logiciels de bio-informatique.

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رقم الوثيقة

f57d7212-d380-4dd1-8ff2-7ff7f1e0cb07

رقم العقد

0

نوع الوسائط

Crawler

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الرسائل العلمية

صيغة المصدر

ماستر (LMD)

نوع الملف

pdf text

أسماء الملفات

2292248_1.pdf

بيانات النشر

ألقاب المؤلفين

[{"name_ar":"خولة حازم","title_ar":"اعداد","title_en":"Preparation"},{"name_ar":"عائشة خالدي","title_ar":"اعداد","title_en":"Preparation"},{"name_ar":"فاطمة الزهراء مغطيط","title_ar":"اشراف","title_en":"Supervision"},{"name_ar":"مريم بالعوضي","title_ar":"اعداد","title_en":"Preparation"}]

اللغة

French

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Etude in silico d'une mutation:application à la mutation fonctionnelle G719X du gène EGFR retrouvée dans les cancers bronchiques non à petites cellules

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كلمات الباحثين

EGFR protein, Mutation, effect, in silico, Bioinformatic

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الإشراف

فاطمة الزهراء مغطيط

الإعداد

خولة حازم, عائشة خالدي, مريم بالعوضي

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