Les Méthodes de reconstruction phylogénétique: Modèles, Exploitation des Logiciels et Applications à Medicago L. (Fabaceae.)

الموضوعات

علوم بحتة وطبيعية

الملخص

Dans ce mémoire, nous avons tout d’abord exposé la méthodologie de la reconstruction phylogénétique : Nous avons abordé les problèmes de l’échantillonnage, le choix des caractères donc, nous avons récupérer les séquences nucléotidique de la base de donnée Gen Bank, on a trouve que M.truncatula et M.sativa sont les deux espèces les plus étudiées dans le genre Medicago, et le gène qui est le plus utilisé pour la phylogénie et le gène chloroplastique, qui s’est avéré le plus utile pour les analyses phylogénétiques. Les séquences chloroplastiques obtenus seront traitées par le logiciel MEGA 5 en passant par un alignement multiple en utilisant le programme ClustalW, puis la méthode(UPGMA) pour inférer les phylogénies du genre Medicago. Les groupements taxonomiques générés par les phylogénies obtenues pour 43 espèces sur une combinaison des séquences chloroplastiques sont congruents entre eux mais pas avec ceux d’autres auteurs sur d’autres données et avec la classification traditionnelle excepté pour Medicago Sect. Intertextae. Nos résultats démontrent aussi la monophylie du genre Medicago vis-à-vis du genre proche Trigonella.

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f4c28541-ab13-4640-8130-eb0fa8c5abef

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0

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الرسائل العلمية

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ماستر (LMD)

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ترجمة العنوان

The methods of phylogenetic reconstruction: Models, Software Exploitations and Application to Medicago L. (Fabaceae)

ألقاب المؤلفين

[{"name_ar":" Djamila Benmouhoub","title_ar":"اعداد","title_en":"Preparation"},{"name_ar":"Louiza Derouiche","title_ar":"اشراف","title_en":"Supervision"}]

اللغة

French

المصدر والدورية

اسم المصدر

Les Méthodes de reconstruction phylogénétique: Modèles, Exploitation des Logiciels et Applications à Medicago L. (Fabaceae.)

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ترجمة الملخص

In this paper, we first exposed the methodology of phylogenetic reconstruction: We have addressed the problems of sampling, choice of characters so we retrieve the nucleotide sequences of the GenBank database, we has found that M.truncatula and M.sativa are the two most studied species in the genus Medicago, and the gene that is most used for phylogeny and the chloroplast gene, which proved most useful for the phylogenetic analyzes. Chloroplast sequences obtained will be processed by the MEGA software 5 via a multiple alignment using the ClustalW program, then the method (UPGMA) to infer phylogenies of Medicago. Taxonomic groupings generated phylogenies obtained for 43 species on a combination of chloroplast sequences are congruent with each other but not with those of other authors on other data and with the traditional classification except for Medicago Sect. Intertextae. Our results also demonstrate the monophyly of Medicago vis-à-vis the closest kind Trigonella

كلمات الباحثين

Modèles Phylogénie Vicia L Hyoseris L Medicago L. Taxonomie Hérédité paternelle

إشراف وإعداد

الإشراف

Louiza Derouiche

الإعداد

Djamila Benmouhoub

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