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رسائل دكتوراة الفرنسية 2019 f0679188-6f43-4aa6-9b17-8001a8a25415

Etude conceptuelle de la compétence rhizosphérique chez les rhizobactèries phytobénéfiques (PGPR

Berdja Rafik, مسعود بن شعباني

كلية علوم الطبيعة والحياة-جامعة سعد دحلب - البليدة · الجزائر

الموضوعات

طب

الملخص

La nutrition en fer pour les bactéries, présente un défi fondamental en raison de sa très faible solubilité dans les sols agricoles. Pour une croissance optimale, les bactéries telluriques du genre est souvent relatée dans la stimulation de la croissance d'explantés, l’induction systémique de la résistance, ainsi que le biocontrôle de des agents phytopathogènes, nonobstant les avantages écologiques de compétition et de colonisation rhizosphère procurés aux rhizobactéries.Le présent travail est axé principalement sur l’étude des sidérophiles chez les Pseudopodes fluorescent. Sur le plan biologique, les essais portent sur des aspects de colonisation rhizosphérique, de synthèse et de caractérisation (sidrérotypage). Sur le plan conceptuel, nous procédons à une étude de simulation in silice.Les essais, conduits en microcosmes, en interaction avec des plantules de tomate, de lin et de blé dur, en conditions normales et de déficit en fer, ont montré que les souches étudiés se caractérisent par des compétences rhizosphères appréciables, avec des seuils de colonisation atteignant 1011 CFU/g de sol et ce en dépit de leurs origines végétales initiales. Dans des essais complémentaires mettant en évidence le rôle des sidérophiles, il a été observé que pour le cas du mutant déficient en pyodermites (pvd -), une colonisation appréciable de la rhizosphère a été néanmoins obtenue. Ainsi, la sécrétion de pyodermites n’est pas le seul mécanisme impliqué dans le processus complexe de la compétence rhizosphère. En utilisant des souches bactériennes modèles, en parallèles avec leurs mutants déficients en synthèse de pyoverdines(pvd-), les opérations de ont révélé, certes la présence de Faverdines caractéristiques pour ce type de bactéries, mais également l’existence de formes variables, considérées comme des Faverdines atypiques.L’étude conceptuelle de la compétence photosphérique (Paramétrisation & analyse de sensibilité) a été conduite avec la souche de Pseudopodes fluorescent pf-10, à travers l’étude d’un modèle mathématique issu d’une conceptualisation qualitative-phénoménologique du processus de chélation du fer en milieu appauvri. Les résultats de cette étude ont donné des niveaux d’ajustement satisfaisant, et ont permis de prédire la dynamique du fer dans le temps, notamment en l’absence de données expérimentales pouvant servir comme base de comparaison. L'analyse de sensibilité a confirmé avec succès les caractéristiques cinétiques clés de toutes les variables d'état. La conceptualisation indique les composants du système qui devraient être mesurés avec plus de précision, afin d'obtenir de meilleures prédictions en termes de synthèse de pyodermites (rendements pyoverdiniques). () Iron nutrition for bacteria presents a fundamental challenge because of its very low solubility in agricultural soils. For optimal growth, Pseudomonastelluric bacteria chelatefor this element through typical siderophores. Thus, these rhizobacteria by obtaining supplies, make the plants benefit from this freely available iron, which isnecessary for their metabolic activities. The importance of the involvement of siderophores is often related in the stimulation of plant growth, the systemic induction of their resistance, as well as the biocontrol of various plant pathogens, notwithstanding the ecological advantages of competition and rhizospheric colonization provided to rhizobacteria.The present work focuses mainly on siderophores in Pseudomonas fluorescens. On a biological level, the tests concern aspects of rhizospheric colonization, synthesis and characterization (sidrerotyping). In addition, we have tried, to perform a conceptual modelling study on our ownlaboratory practical data.The microcosmic experiments, in interaction with tomato, flax and durum wheat seedlings under normal conditions and iron deficiency, have shown that the applied rhizobacteria strains are characterized by appreciable rhizosphere colonization (1011UFC / g of soil). Despite their initial plant origins, we found high colonization thresholds in the rhizosphere of the various plants studied. In further trials demonstrating the role of siderophores, it was observed that for the case of the pyoverdines deficient mutant (pvd -), appreciable colonization of the rhizosphere was obtained. Therefore, the secretion of pyoverdines is not mechanism involved in the complex process of rhizospheric competence.By using model bacterial strains, in parallel with their mutants deficient in pyoverdines synthesis (pvd-), the operations revealed, certainly the presence of characteristic pyoverdines for this type of bacteria, but also the existence of variable forms, considered as atypical pyoverdines.The conceptual study of the rhizospheric competence (Parametrization & Sensitivity Analysis) was conducted with the Pseudomonas fluorescenspf-10 strain, via the study of a mathematical model resulting from a process iron in depleted environment. The results gave very satisfactory levels of fit, predicting the dynamics of iron over time, especially in the absence of experimental data for comparison. In addition, the sensitivity analysis successfully confirms the key kinetic characteristics of all state variables. The conceptualization clearly indicates the components of thesystem that should be measured more precisely, in order to obtain better predictions in pyoverdines synthesis (pyoverdinic yields)

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رقم الوثيقة
f0679188-6f43-4aa6-9b17-8001a8a25415
رقم العقد
0
نوع الوسائط
Crawler
نوع المحتوى
الرسائل العلمية
صيغة المصدر
رسائل دكتوراة
نوع الملف
pdf text
أسماء الملفات
2222134_1.pdf

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ألقاب المؤلفين
[{"name_ar":"Berdja Rafik","title_ar":"اعداد","title_en":"Preparation"},{"name_ar":"مسعود بن شعباني","title_ar":"اشراف","title_en":"Supervision"}]
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French

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Etude conceptuelle de la compétence rhizosphérique chez les rhizobactèries phytobénéfiques (PGPR

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Berdja Rafik و مسعود بن شعباني. (2019). Etude conceptuelle de la compétence rhizosphérique chez les rhizobactèries phytobénéfiques (PGPR. أطروحة(رسائل دكتوراة). كلية علوم الطبيعة والحياة-جامعة سعد دحلب - البليدة. الجزائر.

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Berdja Rafik و مسعود بن شعباني. Etude conceptuelle de la compétence rhizosphérique chez les rhizobactèries phytobénéfiques (PGPR. 2019. كلية علوم الطبيعة والحياة-جامعة سعد دحلب - البليدة، رسائل دكتوراة.