Régulation de l'expression du géne nifa chez Rhizobium etli: Implication de protéines ( histone-like )

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علوم بحتة وطبيعية

الملخص

Dans le but d’élucider une partie du schéma de régulation qui contrôle le processus de fixation d’azote chez Rhizobium etli CNPAF512, ce travail s’est particulièrement focalisé sur la régulation de l’expression du gène nifA, codant pour l’activateur transcriptionnel clé des gènes nif/fixchez les rhizobia .La protéine NifA représente en effet un acteur majeur dans le processus de fixation d’azote et joue un rôle central dans la transduction du signal en activant et en réprimant la cascade génétique des gènesnif/fix, permettant alors à l’appareillage de fixation d’azote de s’exprimer pendant la symbiose. L’analyse de l’effet de délétions progressives réalisées en 5’ de la région promotrice du gène nif Achez R. etliet l’évaluation de leurs fonctionnalités au niveau du taux d’expression a permis de montrer des différences marquées entre les différentes délétions et selon les conditions de croissance, soulignant bien que des mécanismes régulateurs spécifiques étaient mis en place durant la symbiose. L’interaction du promoteur de nif A avec des protéines régulatrices putatives a également pu être appréciée par des expériences deretardation sur gel, montrant clairement qu’une protéine de type histone-like interagissait de manière spécifique avec la région promotrice pnif A. Le screening du génome entier de la souche R. etlia d’ailleur spermis d’identifier plusieurs clones susceptibles de contenir des protéines de ce type, et, pour l’un d’eux,nous avons pu individualiser un gène, codant pour une protéine que nous avons appelé HURe et que nous avons tenté de caractériser tant par ses propriétés in vitroque in vivo. Nous avons pu montrer que la protéine HURe présente des propriétés de liaison à l’ADN différentes de celle de la protéine HU d’Escherichia coli,propriétés qui permettent de l’individualiser et de souligner que cette protéine, comme les autres protéine shistone-like, reconnaissent préférentiellement une conformation particulière plutôt qu’une séquence d’ADN,mais laissant surtout suggérer qu’elle pourrait jouer un rôle différent dans la cellule

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التعريف والنوع

رقم الوثيقة

ef9da56b-e533-4aad-bc9a-f0b3f88c8eea

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0

نوع الوسائط

Crawler

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الرسائل العلمية

صيغة المصدر

رسائل دكتوراة

نوع الملف

pdf text

أسماء الملفات

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ترجمة العنوان

Regulation of nifA expression in Rhizobium etli: Involvement of ( histone-like ) proteins

ألقاب المؤلفين

[{"name_ar":" Jos Vanderleyden","title_ar":"اشراف","title_en":"Supervision"},{"name_ar":"Rabah Bakour","title_ar":"اشراف","title_en":"Supervision"},{"name_ar":"Traki Hamadouche Benhassine","title_ar":"اعداد","title_en":"Preparation"}]

اللغة

French

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Régulation de l'expression du géne nifa chez Rhizobium etli: Implication de protéines ( histone-like )

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ترجمة الملخص

In order to elucidate the complex regulatory network that controls nitrogen fixation in Rhizobium etli CNPAF512 strain, we focussed our work on the regulation of the expression of nif Agene,coding the key transcriptional activator of the nif/fixgenes in rhizobia. In fact, NifA is the masterregulator of nitrogen fixation and plays a central role in signal transduction by switching on and off the genetic cascade of nif/fixgene activation, ensuring expression of the nitrogen fixation apparatus during symbiosis. Analysis of the effects of 5’ progressive deletions in the promoter region of nif Agene in R. etli and assessment of their functionality at the level of expression allowed us to show marked differences between the different deletions and also depending on the growth conditions, thereby indicating that specific symbiotic regulatory mechanisms are involved. Interaction of the nif A promoter with putative regulatory proteins has been investigated by electrophoretic mobility shift assays as well, clearly showing that a histone-like protein interacts in a specific manner with the promoter region pnifA. Entire genome screening of R. etli strain allowed us to identify several clones that could contain genes coding histone-like proteins. In fact, in one of these clones, we could individualize a gene, coding a histone-like protein we tentatively named HURe. Several in vitro and in vivoexperiments were then realized to characterize the properties of this protein. Therefore, we could show that HURe protein displays distinct binding characteristics to DNA substrate, as compared to Escherichia coli HU protein. These particular properties individualize this protein and indicate that, similarly to other histone-like proteins, HURe interacts in astructure-specific, rather than sequence-specific, manner with DNA, and particularly suggests that it could have a different function in the cell

كلمات الباحثين

, Gène nifA, Escherichiacoli HU, Fixation d’azote, Histone-like protein, HU d’Escherichia coli, HURe protein, nifAgene, Nitrogen fixation, Protéine histone-like, Protéine HURe, Protéine, Rhizobium etli

إشراف وإعداد

الإشراف

Jos Vanderleyden, Rabah Bakour

الإعداد

Traki Hamadouche Benhassine

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