Genetic characterization of dromedary camel (Camelus dromedarius) population in Tunisia Caractérisation génétique du dromadaire (Camelus dromedarius) en Tunisie

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زراعة

الملخص

The dromedary camel (Camelus dromedarius) has large socio-cultural and economic importance in the arid lands of Tunisia. This zoogenetic resource hasbeen managed in a traditional mode, with a feeble selective pressure. In the insufficiency of genetic studies describing this population in Tunisia, the present research work affords foundations for the genetic improvement of this species. It offers a comprehensive description of the genetic variability, the structure and the recent history of this population. The genetic variability was investigated on the autosomal DNA, by amplifying 20 microsatellite markers, and on the mitochondrial DNA, by sequencing two mt DNA regions (the control region and cytochrome bgene). The nucleic markers analysis demonstrated a high level of variability and aweaksubstructure (FST= 0.02)of the Tunisi and romedary population. The known ecotypes, defined on the basis of phenotypic and morphologic characters, were faintly observed at the genetic level. The population showed a large admixture, close genetic distances and an important gene flow (Nm = 7) between the ecotypes and between the geographic areas. The population also exhibited a moderate inbreeding level (FIS= 0.2). The mitochondrial DNA analysis allowed the evaluation of the phylogeographic origin of the studied population. It proved that two maternal lineages are present at differential proportions. The most abundant haplotype (> 80 %) was identical to that largely present in most dromedary populations in Asian and African continents. The second lineage (5 %) was more genetically close to haplotypes recorded in the relatively isolated Eastern African dromedary population. In a final part of this study, we designed an efficient and affordable parentage assay to check camel This assay willafford the possibility of tracing back the genealogy of animals of high performance. Implications of the present genetic evaluation in the camel development plans were addressed. The study emphasized that thecameline genetic resources in Tunisia provide promising potential that ought to be exploited for sustainable food security in arid lands, through strategic and judicious management and development plans.

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[{"name_ar":"Ghada Nouairia Jebah","title_ar":"اعداد","title_en":"Preparation"},{"name_ar":"Mohammed Habib Yahyaoui","title_ar":"اشراف","title_en":"Supervision"}]

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Genetic characterization of dromedary camel (Camelus dromedarius) population in Tunisia Caractérisation génétique du dromadaire (Camelus dromedarius) en Tunisie

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Malgré l’importance socio-culturelle et économique des dromadaires (Camelus dromedarius), ces ressources génétiques sont généralement conduites selon un mode d’élevage traditionnel, caractérisé par une faible pression sélective. De plus, les connaissances sur la structure de cette population restent limitées et l’origine et l’histoire de cette population n’ont pas été abordées auparavant. Dans ce cadre, le travail présent consiste à évaluer la diversité génétique, les origines et l’histoire récente des camelins en Tunisie, sur la base d’une analyse moléculaire. Pour ce faire, nous avons utilisé des marqueurs nucléaires (20 microsatellites) et des marqueurs mitochondriaux (la séquence de la région de contrôle et celle du gène cytochrome b). Les analyses basées sur les marqueurs microsatellites ont mis en évidence unevariabilité génétique importante au sein de la population étudiée. L’étude a aussi révélé que la diversité génétique observée est expliquée par la différence entre individus et que les écotypes connus chez les éleveurs sont peu différenciés au niveau génétique. Une large proportion du matériel génétique est partagée par les différents , reflétant fidèlement les pratiques de reproduction non controlée et les zones d’élevage à la fois limitées et rapprochées. Un risque modéré de consanguinité est aussi décelable (FIS= 0.2), ce qui nécessite un travail de sensibilisation chez les éleveurs. Les implications de cette évaluation génétique dans la mise en place de programmes de gestion ainsi que dans la mise en œuvre d’un programme d’amélioration génétique des dromadaires en Tunisie ont été abordées. L’analyse du polymorphisme de l’ADN mitochondrial a permis de confirmer les résultats sur la diversité génétique et a révélé l’existence de deux lignées maternelles. La lignée abondante provint de l’origine de domestication, le Moyen Orient, la deuxième est génétiquement proche de la population de l’Est de l’Afrique. Enfin, vu l’absence des pratiques de contrôle et de suivi dans la plupart des troupeaux de dromadaires en Tunisie, on a déveloPé un test de parenté efficace, basé sur les marqueurs microsatellites. Ce test permettra le traçage des relations généalogiques, notamment des individus à potentiel productif important.

إشراف وإعداد

الإشراف

Mohammed Habib Yahyaoui

الإعداد

Ghada Nouairia Jebah

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