Identification and Molecular Characterization of Thermo Tolerant Fecal Coliforms and Bacterial Pathogens -E.coli, Salmonella spp and Shigella spp- in Ein-Elbalad Spring in Battir

الموضوعات

علوم بحتة وطبيعية

الملخص

Battir is a Palestinian village located 6.5km north-west Bethlehem city with a populationof approximately 5000 people. Ein El-Balad spring is a vital water source in Battir sincewater supply for the village is not available all the time especially in summer season.Recent reports indicated a serious contamination in the spring water. Among manysources of contamination, waste water intrusion from cesspits is the major source ofcontamination for the spring. Molecular techniques provide a powerful robust analysis indetection of bacterial cells in water even if they exist in small quantities. In this thesis thepresence of thermo-tolerant fecal coliform bacteria in the spring have been identifiedusing membrane filter culture technique and some coliform isolates were characterizedby polymerase chain reaction (PCR) targeting the 16S rDNA gene followed by Sangersequencing. In addition the possible presence of bacterial pathogens E.coli, Salmonellaspp and Shigella spp has been detected by PCR using species specific primers followedby MISeq next generation sequencing. Results showed a high number of thermo-tolerantfecal coliform bacteria and the presence of coliform isolates that are of a pathogenicnature, moreover PCR detection using species specific primers has shown that the springwater does not contain any Salmonella or Shigella species but contain E.coli. NextGeneration Sequencing analysis targeting E.coli bacteria indicated the presence ofwaterborne pathogenic strains of E.coli

روابط وملفات

التعريف والنوع

رقم الوثيقة

ee186ac2-70f9-40cd-8a02-77cb55bbd70d

رقم العقد

0

نوع الوسائط

Crawler

نوع المحتوى

الرسائل العلمية

صيغة المصدر

رسائل ماجيستير

نوع الملف

pdf text

أسماء الملفات

1819851_1.pdf

بيانات النشر

ألقاب المؤلفين

[{"name_ar":"Ghassan Handal","title_ar":"اشراف","title_en":"Supervision"},{"name_ar":"Joseph Ibrahim Danho","title_ar":"اعداد","title_en":"Preparation"}]

اللغة

English

المصدر والدورية

اسم المصدر

Identification and Molecular Characterization of Thermo Tolerant Fecal Coliforms and Bacterial Pathogens -E.coli, Salmonella spp and Shigella spp- in Ein-Elbalad Spring in Battir

المحتوى والصفحات

عدد الصفحات

0

ترجمة الملخص

بتير هي قرية فلسطينية تقع 5,6كم شمال غرب بيت لحم ويبلغ عدد سكانها تقريبا 5000 نسمة نبع عين البلد في بتير هو مصدر هام للمياه في القرية حيث ان إمدادات المياه للقرية لا تكفى احتياجاتها في كل وقت وخاصة في فصل الصيف. تشير التقارير الأخيرة إلى تلوث خطير في مياه النبع، ومن بين العديد من مصادر التلوث تشكل تسرب المياه العادمة من الحفر الامتصاصية المصدر الرئيسي للتلوث في هذا النبع. توفر التقنيات الجزيئية التحليل الدقيق والقوي في الكشف عن مسببات الأمراض في المياه حتى تلك الموجودة بكميات صغيرة جدا. في هذا الاطروحة تم الكشف عن وجود بكتيريا القولونيات البرازية المقاومة للحرارة في مياه النبع باستخدام تقنية الفلترة بالغشاء وتم تمييز بعض العزلات باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل الذي يستهدف جين (16S rDNA) متبوعا بتقنية سانجر لكشف التسلسل الجيني. بالإضافة الى ذلك تم الكشف عن امانية وجود البكتيريا المسببة للمرض الإشريكية قولونية، السلمونيلا والشيغيلا باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل الذي يستهدف النوع البكتيري بشكل خاص متبوعا بتقنية المايسك للتسلسل الجيني من الجيل الثاني. أظهرت النتائج وجود عدد كبير من البكتيريا القولونية في مياه النبع وأظهر التصنيف الجزيئي لبعض العزلات من بكتيريا القولونيات البرازية ان معظم هذه العزلات ذات طابع مسبب للمرض. النتائج الخاصة بالكشف عن البكتيريا المسببة للامراض إشراكية قولونية. السلمونيلا والشيغيلا اظهرت خلو المياه من السلمونيلا والشيغيلا وتاكيد وجود الإشراكية قولونية. كشفت تقنية المايسك لتسلسل الجيني من الجيل الثاني التي استهدفت بكتيريا الإشراكية قولونية عن وجود يكتيريا الإشراكية قولونية ذات طابع مسبب للمرض من خلال المياه.

كلمات الباحثين

Science in Bitechnology

إشراف وإعداد

الإشراف

Ghassan Handal

الإعداد

Joseph Ibrahim Danho

الاقتباسات الببليوغرافية