Prevalence of Metallo-B-lactamase acquired genes among carbapenems susceptible and resistant Gram negative clinical isolates using multiplex PCR, Khartoum Hospitals, Khartoum-Sudan

الموضوعات

علوم بحتة وطبيعية

الملخص

The emergence and rapid spread of bla-IMP, bla-VIM, and bla-NDM metallo-beta-lactamase (MBL) producing Gram-negative bacteria causing nosocomial infections are of concern worldwide due to limited treatment options.The aim of this study was to determine the prevalence of MBLs resistance genes by multiplex PCR method using three sets of primers, among 200 different clinical Gram-negative isolates (Citrobacter spp, E.coli, Enterobacter spp, K.pneumoniae, Ps.aeruginosa, P.mirabilis, and P.valgaris). 100 sensitive and the other 100 resistant to Carbapenems, collected from different hospitals, Khartoum State – Sudan. During 2015 to 2016. Based on PCR assays, 72 (36.1 %) out of 200 Gram negative clinical isolates, were positive for MBLs genes. Out of 100 Carbapenems, sensitive bacterial isolates (27%) were positive for MBLs, while among 100 Carbapenems resistant bacteria isolates (45%) were positive for MBLs resistance genes. There was statistically significant association between the antimicrobial susceptibility and the PCR result (P-value = 0.008).Verona integron metallo beta lactamase (VIM) gene was the most frequent, detected in 28 (38.9%) out of 72 positive MBLs genes, followed by imipenemase (IMP) which detected in 19(26.4%), and New Delhi Metallo beta lactamase (NDM) was the least are detected in 3(4.2%). Statistically significant association was found between susceptibility and these MBLs genes with (P-value = 0.03).E.coli was the predominant isolates detected harboring MBLs genes 26 (36%), followed by Ps.aeruginosa 23(32%), K.pneumoniae 20(28%), P.mirabilis 2(2.8%) and P.valgaris 1(1.4%). While there was no statistically significant association between the MBLs genes and carbapenem sensitive & resistant, clinical isolates (P-value = 0.275).Identification of MBLs producing strains and taking efforts to reduce the rate of transfer of these genes between different strains is essential for optimization of therapy and improves of patient outcomes.

روابط وملفات

التعريف والنوع

رقم الوثيقة

0f466dae-e221-481d-a430-854fcbcb7242

رقم العقد

0

نوع الوسائط

Crawler

نوع المحتوى

الرسائل العلمية

صيغة المصدر

رسائل ماجيستير

نوع الملف

pdf text

أسماء الملفات

63013_1.pdf

بيانات النشر

ألقاب المؤلفين

[{"name_ar":"Mudathir Abdullah Adam Ismail","title_ar":"اعداد","title_en":"Preparation"},{"name_ar":"Wafa Ibrahim Elhag","title_ar":"اشراف","title_en":"Supervision"}]

اللغة

English

المصدر والدورية

اسم المصدر

Prevalence of Metallo-B-lactamase acquired genes among carbapenems susceptible and resistant Gram negative clinical isolates using multiplex PCR, Khartoum Hospitals, Khartoum-Sudan

المحتوى والصفحات

عدد الصفحات

0

ترجمة الملخص

إنتشار البكتيريا سالبة الجرام المنتجة لعوائل جينات الميتالوبيتالاكتميز التالية (ڤى آى أم و آى أم بى و نيودلهي) يؤدى الى مقاومة المكيروبات للمضادات الحيوية المستخدمة لعلاج الالتهابات البكتيرية والتي تعتبر مشكلة ذات منحى عالمي.هدفت هذه الدراسة الى إستقصاء نسبة انتشار جينات الميتالوبيتالاكتميز بواسطة الكشف الجزيئي، شملت الدراسة 200 عزلة سريرية حوت الفصائل التالية (الأشريكية القولونية، الكلبسيلا الرئوية، الزائفة الزنجارية، المتقلبة الرائعة، المتقلبة الإعتيادية، السيتروباكتر والإنتيروباكتر)، مقسمة الى 100 عزلة سريرية حساسة للكاربنيمات و100 عزلة سريرية مقاومة لها. تم جمعها من عدة مستشفيات بولاية الخرطوم في الفترة من 2015 الى 2016م.استنادا إلى فحوصات البلمرة المتسلسلة (بى سى أر) في عدد 200 عزلة سريرية من البكتيريا سالبة الجرام تم الكشف عن 72 بكتيريا ايجابية للجينات فلزية البيتالاكتميز بنسبة تفشى (%36.1). وكان عدد الجينات فلزية البيتالاكتميز الإيجابية من أصل 100 سلالة بكتيرية حساسة للكاربنيمات 27 بنسبة انتشار (27 (%، في حين كان عددها 45 بين الـ 100 عزلة بكتيرية المقاومة للكاربنيمات بنسبة انتشار وقدرها (45%). تم رصد علاقة ارتباط إحصائي معنوي بين قابلية العزلات السريرية للكاربنيمات ونتائج تفاعلات البلمرة المتسلسلة قيمتها (0.008) .كشفت هذه الدراسة أن عائلة فيرونا إنتجرون ميتالوبيتالاكتميز (ڤى آى أم) هي أكثر الجينات شيوعا بعدد 28 من أصل 72جين ميتالوبيتالاكتميز إيجابي وبنسبة تفشى وقدرها (38.9%)، تليها عائلة (آى أم بى) التي اكتشفت في عدد 19 (%26.4) وأخيرا عائلة نيودلهي ميتالوبيتالاكتميز اكتشفت في 3(%4.2). تم العثور على ارتباط إحصائي معنوي بين قابلية العزلات السريرية للكاربنيمات مع هذه الجينات بقيمة قدرها (0.03).الإشريكية القولونية هي أكثر أنواع العزلات السريرية سالبة الجرام التي تؤوى جينات الميتالوبيتالاكتميز بنسبة انتشار (%36)، تليها الزائفة الزنجارية بنسبة (%32)، الكلبسيلا الرئوية بنسبة (%20)، المتقلبة الرائعة (%2.8) والمتقلبة الإعتيادية (%1.4). في حين لم يكن هناك علاقة ذات دلالة إحصائية بين هذه العزلات وجينات الميتالوبيتالاكتميز، القيمة المعنوية (0.275).الكشف عن وجود هذه الجينات والعمل على تقليل طرق انتقالها بين سلالات البكتيريا المختلفة تؤدى إلى رفع كفاءة العلاج وتحسين سبل شفاء المرضى.

إشراف وإعداد

الإشراف

Wafa Ibrahim Elhag

الإعداد

Mudathir Abdullah Adam Ismail

الاقتباسات الببليوغرافية