Effect of IL-17 Gene Polymorphism in Tuberculosis Patients in Babylon Province

الموضوعات

طب

الملخص

The case-control study was aimed to evaluate the polymorphism effect of interleukin-17 A on susceptibility to pulmonary tuberculosis in Babylon province.A total of 122 suspected pulmonary tuberculosis cases 42(34.4%) direct smear positive and 80(65.5%) direct smear negative, the culture was positive in 12(9.8%) samples and the remaining 110(90.1%) was negative. the sensitivity, specificity, positive predictive value, negative predictive value and accuracy was (70%, 30%), (93.9%, 100%), (91.3%, 100%), (77.5%, 59%)and(82.5%, 65.57%) for direct smear and culturing respectively. Out of 122 suspected pulmonary tuberculosis cases 60(49.1%) samples detected by GeneXpert as Mycobacterium tuberculosis and the remaining 62(50.8%) was negative, nucleic acid amplification of IS6110 was positive in 36(29.5%)and the remaining 86(70.5)was negative. The sensitivity, specificity, positive predictive value, negative predictive value and accuracy was (98.31%, 60%), (98.41%, 100%), (98.31%, 100%), (98.41%, 72%)and(98.36%, 80.33%) for GeneXpert and nucleic acid amplification test respectively.The immunological reaction against tuberculin skin test appeared out of 122 suspected pulmonary tuberculosis, 80(65.6%) positive cases and the remaining 42(34.4%) case was negative. The sensitivity, specificity, positive predictive value, negative predictive value and accuracy was (100%), (75.6%), (80%) (100%)and(87.65%) for tuberculin skin test respectively. The pulmonary tuberculosis confirmed in 60 cases(58 new, 2 relapsed)by the gold-standard laboratory test, GeneXpert, due to high accuracy compared with other test.The demographic data of 60 pulmonary tuberculosis cases appeared 34(57%) of cases was male and 26(43%) was female. The mean age ± standard deviation of all cases was (39±16.67), for male was (44.67 ±16.98)and (32.38 ± 13.38)for female. The age range for more frequent cases was 35-44, 15-24 for male and female respectively.Out of 60 pulmonary tuberculosis cases, 36 (60%) of cases was for prisoners and prison exposure. The geographic distribution of cases was 75% in rural area and the remaining 25% in urban area. Seasonal distribution of cases was 12(20%), 17(28.3%), 20(33.33%), 11(18.3%) in winter, spring, summer, and autumn respectively. The serum level of interleukin-17A was detected for 60 cases and 63 control(33 control, 30 apparently healthy contact), the mean ± standard deviation was (207.42± 68.5), (231.5± 113.11), and (303.53± 143.96)for pulmonary tuberculosis cases, healthy control and healthy contact respectively. The polymorphism ofinterleukin-17A gene at rs2275913 and rs3819025 was detected for 60 cases and 63 control (33 control, 30 apparently healthy contact). For rs2275913 the genotype (AA, AG, GG) was (5, 58.33, 36.67) %, (9.09, 3.36, 54.55) %, (20, 20, 60) % for pulmonary tuberculosis cases, healthy control, and healthy contact respectively. The odd ratio (95% confidence interval) of the genotype AG was 3.56(1.653-7.4) that mean risk allele for patients compared with 0.315(0.081-1.22), 0.434(0.21-0.89) for AA, GG respectively that mean protective all elef or control group.For rs3819025the genotype (AA, AG, GG) was (0, 25, 75) %, (3.03, 12.12, 84. 85) %, (0, 13.3, 86.67) % for pulmonary tuberculosis cases, healthy control, and healthy contact respectively. The odd ratio (95% confidence interval) of the genotype AG was 2.29(0.89-5.89) that mean risk allele for patients compared with 0.344(0.013-8.6), 0.523(0.2-1.24)for AA, GG respectively that mean protective allele for control group.The sex distribution among the polymorphism genotype (AA, AG, GG) was (3, 0) %, (38.33, 20) %, (18.33, 18.33) % for male and female respectively.The gene expression of interleukin-17A was detected for pulmonary tuberculosis cases and healthy contact, the mean ± standard error of folding was 2.373±0.08, 5.696±0.13 respectively that appeared significant differences at P<0.001

روابط وملفات

التعريف والنوع

رقم الوثيقة

0960eb92-93da-4485-96fe-7c53b7919115

رقم العقد

0

نوع الوسائط

Crawler

نوع المحتوى

الرسائل العلمية

صيغة المصدر

رسائل دكتوراة

نوع الملف

pdf text

أسماء الملفات

997144_1.pdf

بيانات النشر

ترجمة العنوان

تأثير التنوع الجيني ل IL-17 في مرضى التدرن الرئوي في محافظة بابل

ألقاب المؤلفين

[{"name_ar":"ايفاد كريم عبد الشبلي","title_ar":"اشراف","title_en":"Supervision"},{"name_ar":"محمد عبد كاظم السعدي","title_ar":"اشراف","title_en":"Supervision"},{"name_ar":"مصطفى جواد عبد خضير","title_ar":"اعداد","title_en":"Preparation"}]

اللغة

English

المصدر والدورية

اسم المصدر

Effect of IL-17 Gene Polymorphism in Tuberculosis Patients in Babylon Province

المحتوى والصفحات

عدد الصفحات

0

ترجمة الملخص

هدفت الدراسة الحالية لتقييم تأثير تعدد الأشكال الجيني للانترلوكين -17صنف Aعلى قابلية إصابة الأشخاص بمرض السل الرئوي في محافظة بابل. من أصل 122حالة السل الرئوي مشتبه بها 34.4( 42)٪ عينة موجبة لفحص المسحة المباشر و )٪ 65.5( 80عينة سلبية للمسحة المباشرة، نتيجة الزرع علىا لوسط المائل كانت إيجابية في )٪ 9.8( 12عينة اما العينات المتبقية )٪ 90.1( 110كانت سلبية.كانت الحساسية، والنوعية، والقيمة التنبؤية الإيجابية، والقيمة التنبؤية السلبية والدقة (93.9( ،)٪ 30 ،٪ 70،٪ )٪ 59 ،٪ 77.5( ،)٪ 100 ،٪ 91.3( ،)٪ 100و ( )٪ 65.57 ،٪ 82.5لطريقة المسحة المباشرة والزرع على التوالي. من بين 122حالة يشتبه في إصابتهم بمرض السل الرئوي )٪49.1( 60تم الكشف المتبقية62 والـGeneXpert بواسطة جهازMycobacterium tuberculosis عن وجود بكتريا( )٪50.8كانت سلبية، كان تضخيم الأحماض النووية للتسلسل الاندساسي IS611موجبا في 36( )٪29.5عينة والبقية )70.5( 86كان سلبية. كانت الحساسية والنوعية والقيمة التنبؤية الإيجابية والقيمة،٪ 98.41( ،)٪ 100 ،٪ 98.31( ،)٪ 100 ،٪ 98.41( ،)٪ 60 ،٪ 98.31( التنبؤية السلبية والدقة )٪ 72و ( )٪ 80.33 ،)٪ 98.36لاختبار GeneXpertواختبار تضخيم الحمض النووي على التوالي.اظهر رد الفعل المناعي ضد اختبار التيوبركولين الجلدي ان من أصل 122من حالات السل الرئوي المشتبه فيها، ظهرت 80حالة ( )٪ 65.6إيجابية، ام المتبقية )٪ 34.4( 42سلبية. كانت الحساسية، والنوعية،والقيمة التنبئية الإيجابية، والقيمة التنبئية السلبية والدقة لاختبار التيوبركلين الجلدي (،)٪ 75.6( ،)٪ 100( )٪ 100( )٪ 80و ( )٪ 87.65على التوالي. تم التأكد من الإصابة بمرض السل الرئوي في 60حالة( 58حالة جديدة، ناكس )2بواسطة الاختبار المعياري الذهبي المعياري، ،GeneXpertوذلك بسبب الدقة العالية مقارنة بالاختبارات الأخرى. ظهرت البيانات الديموغرافية ان من اصل 60حالة سل رئوي 57( 34)٪ ذكور )٪ 43( 26اناث. كان متوسط العمر ± الانحراف المعياري لجميع الحالات (،)16.67 ± 39 Iللذكور ( )16.98 ± 44.67و( )13.38 ± 32.38للإناث. كانت الفئة العمرية لأكثر الحالات تك ار ار -35 24-15 ،44للذكور والإناث على التوالي. )٪60( 36من حالات السل الرئوي كان للسجناء والمتعرضين للسجناء. كان التوزيع الجغرافي للحالات ٪ 75في المناطق الريفية و ٪ 25المتبقية في المناطق الحضرية.كان التوزيع الموسمي للحالات )٪20( 12و )٪28.3( 17و )٪33.33( 20و )٪18.3( 11في الشتاء والربيع والصيف والخريف على التوالي. تم الكشف عن مستوى المصل انترليوكين- A17ل 60حالة تدرن رئوي و 63حالة سيطرة ( 33السيطرة، 30ملامسين اصحاء،) كان الانحراف المعياري والمتوسط) لحالات السل الرئوي ، حالات143.96 ± 303.53()، و113.11 ± 231.5( ،)68.5 ± 207.42(السيطرة الاصحاء والملامسين الاصحاء على التوالي. تم الكشف عن تعدد الأشكال لجين انترلوكين-A17في الموقع الجيني rs2275913و rs3819025للحالات المصابة ال 60و 63حالات السيطرة (33السيطرة، 30ملامسين اصحاء.) بالنسبة إلى rs2275913كان النمط الوراثي ( AG ،AAو،5( :(GG)٪ لحالات السل الرئوي ، مجموعة60 ، 20 ، 20 (، ٪)54.55 ، 3.36 ،9.09 (، ٪(36.67 ،58.33السيطرة الاصحاء ، والملامسين الاصحاء على التوالي . كانت النسبة الفردية (فاصل الثقة )٪ 95للنمطالجيني )1.653-7.4( 3.56 :AGالتي تعني ان هذا الشكل الوراثي يسبب عامل خطورة على المصابين

كلمات الباحثين

Pulmonary Tuberculosis, Interleukin-17A, Gene Expression, Genetic Polymorphism, Risk Alleles, Predisposing Factors

إشراف وإعداد

الإشراف

ايفاد كريم عبد الشبلي, محمد عبد كاظم السعدي

الإعداد

مصطفى جواد عبد خضير

الاقتباسات الببليوغرافية