Screening for Genetic Variation in the Circadian Clock in Diverse Barley Collection

الموضوعات

زراعة

الملخص

The circadian clock is an endogenous self-sustaining mechanism which regulates a wide variety of rhythmic molecular and physiological processes during the 24-h period and thus allows plants to adapt to different daily and seasonal changes in their environment. However, there is little information about how the circadian clock has an impact on crop performance. In barley plants (Hordeum vulgare), the core oscillator mechanism which generates circadian rhythms consists of several components: CIRCADIAN CLOCK ASSOCIATED1 (CCA1) is a morning-expressed transcription factor, while TIMING OF CAB EXPRESSION 1 (TOC1) is considered an evening-expressed transcription factor. As elements of the core oscillator, regulation of these genes is an important part of the circadian clock, and uncovering those regulatory mechanisms can shed light on how the clock works and how it incorporates environmental feedback. The main objectives of this study are to identify natural variation in the circadian clock in a collection of barley accessions using high-throughput measurements of chlorophyll fluorescence (F) and to determine the variation of circadian parameters in response to environmental variation. Chlorophyll fluorescence (F) measurements have been used as a tool for studying circadian rhythms in a collection of 84 different barley accessions, and by using this technique, the correlation between parameters of the circadian rhythms and geographical differences, for example, elevation at the site of origin of the accessions, have also been analyzed. Results obtained from this study indicated that there are circadian oscillations of ~24 hours of F parameters, and these oscillations varied between different barley accessions as a consequence of CCA1, which varied in the regulation of rhythmic oscillations of F parameters. Also, plants showed a strong correlation between parameters of the circadian rhythms of fluorescence and geographical differences at the sites of origin of the barley plants.

روابط وملفات

التعريف والنوع

رقم الوثيقة

08f7ada0-acf7-4931-b6b4-74a18e33dbac

رقم العقد

0

نوع الوسائط

Crawler

نوع المحتوى

الرسائل العلمية

صيغة المصدر

رسائل ماجيستير

نوع الملف

pdf text

أسماء الملفات

862406_1.pdf

بيانات النشر

ترجمة العنوان

البحث عن التنوع الجيني في الساعة البيولوجية في مجموعة متنوعة من الشعير

ألقاب المؤلفين

[{"name_ar":"عبد الرحيم عماد عبد الرحيم حمدان","title_ar":"اعداد","title_en":"Preparation"},{"name_ar":"مروان حداد","title_ar":"اشراف","title_en":"Supervision"},{"name_ar":"منقذ اشتية","title_ar":"اشراف","title_en":"Supervision"}]

اللغة

English

المصدر والدورية

اسم المصدر

Screening for Genetic Variation in the Circadian Clock in Diverse Barley Collection

المحتوى والصفحات

عدد الصفحات

0

ترجمة الملخص

الساعة البيولوجية هي آلية متكيفة ذاتيا التي تنظم مجموعة واسعة من العمليات الفسيولوجية والجزيئية خلال فترة 24 ساعة وبالتالي تتيح للنباتات خاصية التكيف مع مختلف التغيرات اليومية والموسمية في بيئتها. ومع ذلك هناك معلومات محدودة حول كيفية تأثير الساعة البيولوجية على أداء المحاصيل. في نبات الشعير (Hordeum vulgare), آلية المذبذب الأساسية تتكون من عدة عناصر هي: معامل النسخ في الصباح (CCA1) و معامل النسخ في المساء (TOC1). وتنظيم هذه الجينات هو جزء مهم من الساعة البيولوجية, والكشف عن تلك الآليات التنظيمية يمكن أن يلقي الضوء على كيفية عمل الساعة واقترانها بالبيئة المحيطة.الأهداف الرئيسية لهذه الدراسة هي التعرف على التباين الطبيعي في الساعة البيولوجية في مجموعة متنوعة من الشعير باستخدام تقنية قياس الفلورسنس بالإضافة إلى تحديد اختلاف المعاملات الإيقاعية استجابة للتغيرات البيئية.تم استخدام تقنية قياس الفلورسنس كأداة لدراسة الإيقاعات البيولوجية في مجموعة مختلفة من الشعير, وأيضا باستخدام هذه التقنية تم تحليل العلاقة بين المعاملات الإيقاعية والاختلافات الجغرافية (الارتفاع) في موقع منشأ هذه النباتات. وأشارت النتائج التي تم الحصول عليها من هذه الدراسة إلى أن هناك تذبذبات واضحة ومختلفة بين مختلف نباتات الشعير نتيجةCCA1 التي أحدثت تغيير في تنظيم التذبذبات الإيقاعية للفلورسنس. كما أظهرت النباتات وجود ارتباطا قويا بين المعاملات الإيقاعية للفلورسنس والاختلافات الجغرافية ( الارتفاع) في موقع منشأ النباتات.

كلمات الباحثين

Circadian clock, Barley, Hordeum vulgare, CCA1, TOC1, Chlorophyll fluorescence, Circadian rhythm, Environmental variation, Gene regulation, Plant physiology

إشراف وإعداد

الإشراف

مروان حداد, منقذ اشتية

الإعداد

عبد الرحيم عماد عبد الرحيم حمدان

الاقتباسات الببليوغرافية