Immunological and Allele Specific Genotyping Study Among Patients with SARS-CoV-2

الموضوعات

طب

الملخص

The disease caused by SARS-CoV-2 known as COVID-19, was considered a pandemic by the World Health Organization (WHO) and had the characteristic of being highly contagious and of rapid spread, which led to changes in human habits with an impacted the global health The current study included 125 patients and 60 enrolled as a control group for immunological and genotyping investigations. All patients were admitted to Marjan Medical City, Al-Shomali general hospital, and Al-Sadeq hospital’s COVID‑19 ward in the period between January 2022 to July 2022. The diagnosis COVID‑19 in each patient was confirmed by SARS-CoV-2-positive RT-PCR. Single nucleotide polymorphism (SNPs) for IL-12A-rs568408 and TYK2-rs2304256 were detected by Allele specific-PCR method.ELISA test used to determine concentration of interleukin-35 (IL-35)and presepsin(PSN)in serum. Patients’ group included 56 (44.8%) males and 69 (55.2%) females, whereas, control group included 28 (46.6%)males and 32 (53.4%) females and there was no significant difference in the frequency distribution of patients and control subjects according to sex(P = 0.87).As well as there was no significant difference regarding age between patients and control subjects (P = 0.65).IL-35 showed statistical significant differences between patients 6.86± 2.31ng/ml and control group 3.86± 2.07 (ng/ml) (P< 0.0001). PSN showed statistical significant differences between patients 318.18± 226.62 (pg/ml) and control group 199.68± 39 (pg/ml) (P< 0.0001). The distribution of both genotyping and allele frequencies of IL-12A rs568408 revealed significant differences between patients and control groups (P= 0.006 and p=0.001 respectively). The IL12A rs568408 AA and AG variant genotypes were associated with a significantly increased risk of COVID-19[odds ratio (OR) = 5.19, 95%Confidence interval (CI): 1.13-23.82; P= 0.034] and [OR = 2.39, 95% CI = 1.16-4.94, P= 0.018] respectively compared with the wild-type GG homozygote.Logistic regression analysis revealed that the frequencies of the homozygous variant AA and heterozygous variant AC of TYK2-rs2304256 were 14.4 % and 22.4 % in COVID-19cases and 3.3 % and 16.7 % in healthy controls, respectively. For AA genotype (OR= 5.46, 95% CI: 1.21-24.61; P= 0.027). While AC genotype (OR = 1.7, 95% CI = 0.76-3.81, P = 0.196), at TYK2-rs2304256 demonstrated that AA genotype showed a statistically significant risk for COVID-19in Iraq compared with the wild-type rs2304256 CC. The variant rs568408 AC/AA genotypes were associated with a significantly increased risk of COVID-19(OR= 2.81, 95% CI: 1.37-5.78; P= 0.004), compared with the wild-type rs2304256 CC.In conclusion, IL-35 and Presepsin showed statistical significant differences between patients and controls (P< 0.0001) for each one. IL-35 can be used in diagnosis of COVID-19. The IL12A rs568408 AA and AG variant genotypes were associated with a significantly increased risk of COVID-19. In TYK2-rs2304256, AA genotype showed a statistically significant risk for COVID-19 compared with the wild-type rs2304256 CC

روابط وملفات

التعريف والنوع

رقم الوثيقة

008e9103-bce9-4cf0-a01c-e9375c941da1

رقم العقد

0

نوع الوسائط

Crawler

نوع المحتوى

الرسائل العلمية

صيغة المصدر

رسائل دكتوراة

نوع الملف

pdf text

أسماء الملفات

994360_1.pdf

بيانات النشر

ترجمة العنوان

دراسة مناعية و التنميط الوراثي المتخصص للاليل في المرضى المصابين بفايروس كورونا المستجد

ألقاب المؤلفين

[{"name_ar":"زيتون عبد الرضا الخفاجي","title_ar":"اشراف","title_en":"Supervision"},{"name_ar":"فلاح حسن عبيس جبر","title_ar":"اعداد","title_en":"Preparation"}]

اللغة

English

المصدر والدورية

اسم المصدر

Immunological and Allele Specific Genotyping Study Among Patients with SARS-CoV-2

المحتوى والصفحات

عدد الصفحات

0

ترجمة الملخص

اعتبر المرض الناجم عن SARS-CoV-2 المعروف باسم COVID-19 وباء من قبل منظمة الصحة العالمية (WHO) وكان له خاصية العدوى الشديدة وسرعة الانتشار ، مما أدى إلى تغييرات في عادات الإنسان مع تأثره على الصحة العالمية. شملت الدراسة الحالية 125 مريضا و 60 مسجلين كمجموعة ضابطة في فحوصات المناعية والتنميط الجيني. تم إدخال جميع المرضى إلى مدينة المرجان الطبية ومستشفى الشوملي العام وجناح كورونا فايروس المستجد بمستشفى الصادق في الفترة من يناير 2022 إلى يوليو 2022. تم تأكيد تشخيص كورونا فايروس المستجد لكل مريض بواسطة SARS-CoV-2 -إيجابي RT-PCR. تم الكشف عن تعدد أشكال النوكليوتيدات الفردية (SNPs) لـ IL-12A- rs568408 و TYK2- rs2304256 بواسطة طريقة Allele-PCR المحددة. استخدم اختبار ELISA لتحديد تركيز إنترلوكين 35 (IL-35) وبريسيبسين (PSN) في مصل الدم. اشتملت مجموعة المرضى على 56 (44.8٪) من الذكور و 69 (55.2٪) من الإناث ، بينما ضمت المجموعة الضابطة 28 (46.6٪) من الذكور و 32 (53.4٪) من الإناث ولم يكن هناك فرق معنوي في التوزيع التكراري للمرضى والسيطرة. الموضوعات حسب الجنس (P = 0.87). كان متوسط عمر المرضى 75 (62-85) سنة ، أصغر عمر كان 15 سنة وأكبر عمر كان 90 سنة. كان متوسط عمر الأشخاص الضابطة 74 (64-82) سنة ولم يكن هناك فرق كبير بين المرضى والأشخاص الضابطة (P = 0.65). أظهر IL-35 فروق ذات دلالة إحصائية بين المرضى 6.86 ± 2.31ng / ml ومجموعة التحكم 3.86 ± 2.07 (نانوغرام / مل) (P

كلمات الباحثين

COVID-19; SARS-CoV-2; Interleukin-35 (IL-35); Presepsin (PSN); Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs); IL-12A-rs568408; TYK2-rs2304256; PCR; ELISA; Biomarkers; Immunogenetics

إشراف وإعداد

الإشراف

زيتون عبد الرضا الخفاجي

الإعداد

فلاح حسن عبيس جبر

الاقتباسات الببليوغرافية