Study of Human Gene Polymorphism Associated with Covid-19 Infection in Type 2 Diabetes Mellitus Patients

الموضوعات

علوم تطبيقية وتكنولوجية

الملخص

Compared with previous epidemic infections, Coronavirus has the highest transmission rate and risk of death. On the other hand, diabetes is one of the most prevalent diseases. Thus, diabetics infected with the COVID-19 virus are the most affected. The aim of this research was to find out if there was a correlation between infection with the COVID-19 virus and patients with type 2 diabetes. The study concluded that there has been a relationship between diabetes and patients with COVID-19. The current study was conducted in the molecular laboratory in the Department of Biology, College of Science, University of Babylon. The samples were collected, and the practical part of this study was completed during October (2021-2022). The samples were obtained from patients with COVID-19 and COVID-19, diabetes mellitus, and healthy people. These samples were collected from Marjan Medical Hospital and Al-Saadiq Teaching Hospital in Babylon Governorate, where the total number of samples was 92, including 31 blood samples from healthy people (3 females, 28 males), 30 blood samples from patients infected with COVID-19 (16 females, 14 males), and 31 blood samples from patients infected with COVID-19 + diabetes (17 females, 14 males). The current study has been divided into three parts: the first study was demographic, the second included measuring blood parameters, and the third included a molecular study. The first part included the social and demographic distribution of the study coefficients in terms of gender, level of injury, age, duration of injury, and body mass. The second part included an assessment encompassing the estimation of physiological parameters (HBA1C, FBG, insulin, insulin resistance, insulin sensitivity, CRP, D-dimer, Ferritin), and the third part involved the study of the effects of some genes (ACE2, AT1R, rs657152) determined by PCR. The results of this study showed that gender revealed significant differences at the probability value (p≤0.01) (0.0002) between the two groups of males and females, where the males in the CDM2 group were (46.67%) while in the C group it was (43.3%). The value of females was (56.7%) in group C and it was (48.38%) in group CDM2. The level of infection was classified into three sub-levels including: mild, moderate, and severe. The percentage of the level of cut infection in CDM2 (48.30%) was higher than that of group C (26.66%), while the average level was higher in CDM2 group (38.70%) than it was before. Therefore, the minor level was lower in CDM2 (12.9%) than in group C (43.33%), and the severity of infection increased in CDM2 than in group C. As for the age groups, there were statistically significant differences for the three categories adopted in the current study (>30, 30-50, <50 years). The group of less than 30 years old was more in group C (36.7%) than in the CDM2 category (6.5%), while the 30-50 category was rounded off in the C and CDM2 groups (26.7%, 22.6%). A higher percentage of greater than 50 categories was observed in CDM2 (71%) and the total of C was (36.7%). There were three BMI categories according to the current study including (normal, overweight, and obesity), and there were no statistically significant differences among these groups. As for the injury period, the duration periods were classified into 3 subgroups including (<7, 7-14, >14 days). It was less than 7 days in group C (73.3%) while it was (51.61%) in CDM2, the 7-14 days in group C was (13.33%) and it was (32.25%) in CDM2 group, and more than 14 days was (13.33%) in the CDM2 group and it was (16.12%) in the C group. The differences among groups were significant (p. 0.0311) with a value of (p ≤ 0.05). The results of the physiological study showed significant differences among healthy people and COVID patients along with patients with COVID + diabetes mellitus compared to healthy people in ferritin (108.59±18.4, 322.28±30.1, and 583.10±44.6) respectively, while significant differences at (p≤0.01), showed significant differences in FBG, cumulative glucose, and insulin resistance only in the COVID-19 + diabetes group (253.09±16.2, 9.15±2.0, and 17.51±4.1 respectively) at (p≤0.05) (p≤0.01), and at the same time there was no significant difference among the healthy groups. C-reactive protein or D-dimer showed high values in the COVID-19 group and the COVID-19 + diabetes groups compared with the healthy groups (43.72±5.3, 61.18±5.3, 1731.41±114.5, and 1282.97±221.3) at (p≤0.01) respectively, but it did not show significant differences in insulin and insulin sensitivity. In the molecular study, single nucleotide polymorphism (SNPs) of ACE2 gene was detected by using PCR technique in patients compared with the healthy groups. The group (DD; ID) showed statistically significant differences in relation to the genetic makeup of patients compared with healthy controls at (0.04), whereas I, II did not show any significant relationship. The ACE D genotype was dominant in three groups: (72.6%, 85%, 54%) in the healthy control group, the COVID-19 group, and the COVID-19 + diabetes group respectively, followed by the alleles DD; ID; I. It was observed in AT1R that there was a very significant difference between the healthy group and the group of patients by using polymerase chain reaction techniques PCR-SSCP, where the distribution of DNA polymorphisms was found to be (96.77%, 3.23%) in the healthy group and (6.67%, 93.33%), respectively. In COVID-19 + diabetes group and (12.9%, 87.1) and in COVID-19 + diabetes patients, the results showed that there was no association between DNA polymorphisms according to the number of bands with patients compared to control groups. Meanwhile, there were significant differences in frequencies of the AT1R polymorphism among patients with COVID-19 and COVID-19 with diabetes mellitus and healthy subjects at (P-value ≤ 0.01). As for the rs567152 SNP, the study showed that there were no statistically significant differences among the genetic makeup of patients compared with the genetic makeup of healthy people. Finally, it was observed that patients with diabetes who contracted COVID-19 appeared to have significantly higher levels of (CRP, D-dimer, and Ferritin) and parameters related to diabetes than patients who suffered from COVID-19 alone, also high levels of ACE2 gene, AT1R receptor as such this would make them more likely to develop illness and death.

روابط وملفات

التعريف والنوع

رقم الوثيقة

00168a40-0b5f-40f1-be95-11ae1f1a3804

رقم العقد

0

نوع الوسائط

Crawler

نوع المحتوى

الرسائل العلمية

صيغة المصدر

رسائل ماجيستير

نوع الملف

pdf text

أسماء الملفات

995207_1.pdf

بيانات النشر

ترجمة العنوان

دراسة تعدد الأشكال الجيني في الإنسان المصاحب للإصابة بكوفيد- 19 في مرضى السكري النوع 2

ألقاب المؤلفين

[{"name_ar":"علي حمود السعدي","title_ar":"اشراف","title_en":"Supervision"},{"name_ar":"مريم علي حسين علوان","title_ar":"اعداد","title_en":"Preparation"}]

اللغة

English

المصدر والدورية

اسم المصدر

Study of Human Gene Polymorphism Associated with Covid-19 Infection in Type 2 Diabetes Mellitus Patients

المحتوى والصفحات

عدد الصفحات

0

ترجمة الملخص

بالمقارنة مع الإصابات الوبائية السابقة ، فإن coronavirus لديه أعلى معدل انتقال وخطر الوفاة. من ناحية أخرى ، يعد مرض السكري من أكثر الأمراض انتشارًا. وبالتالي ، فإن مرضى السكر المصابين بفيروس COVID-19 هم الأكثر إصابة. كان الهدف من هذا البحث هو معرفة ما إذا كانت هناك علاقة بين الإصابة بفيروس COVID-19 ومرضى السكري من النوع 2. تتعلق استنتاجات هذه الدراسة بالعلاقة بين مرض السكري ومرضى كوفيد -19 أجريت الدراسة الحالية في المختبر DNA في كلية العلوم ، جامعة بابل. تم جمع العينات واكتمل الجزء العملي من هذه الدراسة في أكتوبر (2021-2022). تم الحصول على العينات من مرضى Covid-19 و Covid-19 ومرض السكري والأشخاص الأصحاء. حيث جمعت العينات من محافظة بابل من مستشفى مرجان الطبية ومستشفى الصادق التعليمي حيث بلغ العدد الإجمالي للعينات الكلي 92 منها 31 عينة دم من اشخاص اصحاء (3 إناث و 28 ذكور) و 30 عينة دم من مرضى مصابين بفيروس كورونا. (16 أناث ، 14 ذكور) و 31 عينة دم من المرضى المصابين بـ COVID-19 + السكري (17أناث ، 14 ذكور). قسمت الدراسة الحالية إلى ثلاثة أجزاء: الدراسة الأولى تناولت الجانب الديموغرافية ، اما الثانية تناولت قياس معايير الدم ، والثالثة تناولت الجانب الجزيئي. تضمن الجزء الأول التوزيع الاجتماعي والديموغرافي من ناحيه الجنس ، ومستوى الإصابة ، والعمر ، ومدة الإصابة ، وكتلة الجسم. تضمن الجزء الثاني تقدير المعلمات الفسلجية (HBA1C ، FBG ، الأنسولين ، مقاومة الأنسولين ، حساسية الأنسولين ،CRP ، D-dimer ، Ferritin) والجزء الثالث تناول تأثيرات بعض الجيناتACE2) ، AT1R، rs657152) بواسطة الـ PCR. أظهرت نتائج هذه الدراسة بخصوص الجنس أظهر فروق معنوية (p≤0.01) بين مجموعتي الذكور والإناث ، حيث كان الذكور اكثر معدلات إصابة في المجموعة CDM2 (46.67 %) بينما في المجموعة C كانت (43.3%) اما الاناث (56.7٪) في المجموعة C وكانت (53.33 %) في المجموعة CDM2. تم تصنيف مستوى الإصابة إلى ثلاثة مستويات: خفيف ، متوسط ، وشديد. كانت النسبة المئوية لمستوى الإصابة في CDM2 (48.30٪) أعلى من المجموعة C (26.66٪) ، اما شدة الاصابة فقد كانت مرتفعة في المجموعة CDM2 (38.70٪) مما كان عليه من (30%) C و كان المستوى البسيط منخفضا الاصابة في CDM2 (12.9٪) منه في المجموعة C (43.33٪) ، وزادت شدة الإصابة في CDM2 عنها في المجموعة C. أظهرت للفئات العمرية فروقا للفئات الثلاث المعتمدة في الدراسة الحالية (> 30 ، 30-50 ، ، 14 يوما). فأن نسبه 7 أيام في المجموعة C (73.3٪) بينما كانت (51.61٪) في CDM2 ، ونسبه 7-14 يومًا في المجموعة C (13.33٪) وكانت (32.25٪) في المجموعة CDM2 ، وأخيرا كانت اكثر بالنسبه الـ 14 يوما (13.33٪) في مجموعة CDM2 و(16.12٪) في المجموعة C. كانت الفروق بين المجموعات معنوية بقيمة ( 0.05P≤ ). أظهرت نتائج الدراسة الفسلجية وجود فروق معنوية بين الأشخاص الأصحاء ومرضى كوفيد بالإضافة إلى مرضى كوفيد + داء السكري في الـ ferritin 583.10±44.6a 322.28±30.1b) (108.5 ±18.4cعلى التوالي عند (p. ≤0.01) ، أظهرت فروقً معنوية في FBS ، HbA1C و INR فقط في مجموعة covid-19 + السكري (17.51±4.1a 9.15±2.01a 253.09±16.2a ) على التوالي عند (p≤0.05) (p≤0.01 ) وفي الوقت نفسه لم يكن هناك فرق بين مجموعه الاصحاء ومجموعه كوفيد-19. اما CRP , D-dimer قيمًا عالية في مجموعة covid-19 + مرضى السكري , 61.18±5.3a) (1282.97±221.3a عند (p≤0.01) على التوالي. وأخيرا لم تظهر فروق معنويه في IN, INS بخصوص الدراسة الجزيئية ، تم اكتشاف تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) لجين ACE2 باستخدام تقنية PCR في المرضى مقارنة مع اشخاص الاصحاء فقد أظهر التركيب الوراثي (DD؛ ID) ذات نسب عالية في مرضى covid-19 و +covid-19 مرضى السكري ذات فروقا معنويه عند (0.04) ، بينما لم تظهر I و II أي علاقة معنويه و كان النمط الجيني ACE D سائدًا في ثلاث مجموعات: (72.6٪ ، 85٪ ، 54٪) في مجموعة الاصحاء ، ومجموعة COVID-19 ، ومجموعة COVID-19 + السكري على التوالي ، تليها الأليلات .(I ,DD,ID) اما في AT1R وجود فروقا معنويه بين الاصحاء و المرضى باستخدام تقنيات تفاعل البوليميراز المتسلسل PCR-SSCP ، حيث وجد أن توزيع تعدد أشكال الحمض النووي كان (96.77٪ ، 3.23٪) في الاصحاء و (6.67٪ ، 93.33٪) في مجموعة covid-19 و (12.9٪ ، 87.1) +covid-19 مرضى السكري ، أظهرت النتائج عدم وجود ارتباط بين تعدد أشكال الحمض النووي وفقًا لعدد الباندات مع المرضى مقارنة بالأصحاء. وفي الوقت نفسه ، كانت هناك اختلافات كبيرة في تعدد الأشكال AT1R covid-19و -19 Covid +مرضى السكري و الأصحاء عند (P≤ 0.01). اما بالنسبة لـ rs567152 SNP فلم يظهر أي فرق معنوي في التركيب الجيني بين الاشخاص الاصحاء والمرضى covid-19و مرضى covid-19+ مرضى السكري أخيرًا ، لوحظ أن مرضى السكري الذين أصيبوا بـ Covid-19 يبدو أن لديهم مستويات أعلى بشكل ملحوظ من (CRP و D-dimer و Ferritin) والمعايير المتعلقة بمرض السكري مقارنة بالمرضى الذين عانوا من Covid-19 وحده ، وكذلك مستويات عالية من جين ACE2 ، مستقبلات AT1R على هذا النحو تجعلهم أكثر عرضة للإصابة بالمرض والوفاة.

كلمات الباحثين

COVID-19, Type 2 Diabetes, Genes, ACE2, AT1R, Molecular Analysis, Insulin Resistance, C-Reactive Protein, Ferritin, D-Dimer.

إشراف وإعداد

الإشراف

علي حمود السعدي

الإعداد

مريم علي حسين علوان

الاقتباسات الببليوغرافية